Супер компютърът Beagle анализира всички данни от 240 генома за два дена

09:32, 22 Февруари 2014

Времето и цената за проследяването на цялата наследствена информация на даден човек значително са намалели през 21 век, но за съжаление анализът на резултатите може да отнеме месеци, предвид факта, че трябва да бъдат декодирани 3.

2 милиарда основни двойки, пише CNEТ. Едно от решенията на проблема е извършването на анализ само на два процента от генома, които кодират протеините. Този метод се нарича екзомно секвениране, съобщава Агенция "Фокус".

Изследователи от Университета на Чикаго съобщиха, че един от най-бързите супер компютри в света може да анализира пълните данни от 240 генома за 50 часа.

Учените са пресметнали, че тази задача би отнела на компютър с процесор от 2.1 GHz повече от 47 години. Невероятната мощност на компютъра Beagle, кръстен на кораба, с който 22-годишният Чарлс Дарвин е пътувал по време на научната си обиколка на света през 1831 година, показва, че анализът на геноми има потенциал да бъде много по-бърз. Изследователите посочват, че са използвали само една четвърт от оперативния потенциал на Beagle в съчетание със софтуерен пакет.

Проследяването на наследствената информация помага за откриването на мутации, водещи до заболявания. При провеждането на екзомно секвениране могат да бъдат намери 85 процента от мутациите, но ако има технологично решение за ускоряване на анализа на цялата информация, биха могли да бъдат проучвани и останалите 15 процента.

Изследователите подчертават, че изследването на цялата информация от няколко генома едновременно би имало незабавен ефект, като това ще даде възможност и за изследване на цели семейства.

Приложенията на анализа отиват отвъд поставянето на диагноза. Установяването на генетични мутации на ранен етап, преди появата на симптоми, ще позволи на учените да разберат повече за първите фази и да търсят нови възможности за лечение.

Вашите коментари

най-ново | най-четени